El San Pedro es un colegio que hace especial hincapié en esta actividad. Nuestra experiencia en el campo de la educación nos indica que la práctica de los deportes es donde más se logra desarrollar determinados rasgos de la personalidad que son de fundamental importancia para la vida, tales como el espíritu de equipo, la humildad, que permite saber ganar sin jactancia y perder sin amargura, la capacidad de sacrificio, el respeto por el otro (sea árbitro, adversario, entrenador o compañero), la perseverancia, etc. Sobre todo en los deportes de equipos.
Por otra parte el deporte ayuda a que los chicos sean sanos no sólo física sino también psicológica y espiritualmente. Es un gran aliado a la hora de luchar contra ciertas tentaciones que aparecen en la adolescencia, tales como tabaco, alcohol, etc.
Razones culturales de nuestro ambiente han determinado que ciertos deportes tengan, por tradición, más códigos de caballerosidad deportiva que otros.
Todas estas razones se tuvieron en cuenta para planificar el siguiente programa de deportes para el colegio San Pedro:
Nivel inicial, primero y segundo año de la primaria: se realizan actividades que los niños interpretan como un juego pero que en realidad están diseñadas para desarrollar la motricidad, la coordinación de los movimientos, y demás condiciones necesarias para poder afrontar luego la práctica de los deportes.
Resto de la primaria: iniciación a la práctica deportiva centrada en las siguientes disciplinas: hockey para las niñas, rugby para los varones, y atletismo para ambos sexos. Actividades complementarias: fútbol, handbol y voley. Competencias intercasas y encuentros intercolegiales. 

Secundaria: Perfeccionamiento de las estrategias deportivas en hockey, rugby y atletismo. Actividades complementarias: fútbol, handbol, voley, aerobics. Competencias intercasas y torneos intercolegiales.  
Es nuestra intención que los alumnos conozcan los deportes en el colegio, se aficionen a ellos, y a medida que crezcan se vayan incorporando a diversos clubes donde puedan seguir practicándolos luego de egresados.